La respuesta rápida es NO (aunque depende del caso concreto).
Si desea una breve explicación siga leyendo.
La rama 3.0.x de Joomla! es una rama que está en desarrollo y que sirve de base para el futuro Joomla! 3.5, que será una versión que tendrá soporte de larga duración, también llamado LTS (Long Time Support).
Muchas de las extensiones de Joomla! (componentes, módulos y plugins) no están adaptados a la nueva versión de Joomla!, y es por ello, que el cambio a la nueva versión 3.0.x del proyecto de Joomla! no es recomendable (mientras que la gran mayoría sí lo son para Joomla! 2.5).
Sólo en el caso de aquellas webs cuyas extensiones necesarias para su funcionamiento sean ya compatibles con Joomla! 3.x, podrían dar el salto a la rama 3 del proyecto. Para comprobar si las extensiones son compatibles con la nueva versión de Joomla! tendrá que revisar cada componente para ver si es o no compatible.
Las más frecuentes (K2, Kunena, JCK, ChronoForms, Allvideos, JCE, etc) podrá consultarlas de forma rápida en el Control de Versiones de Joomla! de NetandSoftware.